In einer dystopischen Gesellschaft wächst Jason, ein 14-jähriger Junge, in der Metropole Nimropia in einer Lehranstalt für Jugendliche auf. In diesen Lehranstalten werden den Jugendlichen Werte und Normen des Weltherrschers Nimrod mittels Drill und Gewalt eingetrichtert. Sein bis dahin tristes Leben bekommt für Jason eine unerwartete Wende, als das mysteriöse Mädchen Namira in seiner Schule auftaucht. Nicht nur, dass sie ihn aus brenzligen Situationen rettet und sowas wie eine Freundin – etwas Verbotenes in der dystopischen Gesellschaft – wird, sondern ihr Vater, Yussuf, offenbart Jason eine unglaubliche Geschichte: Jason ist wie seine verstorbenen Eltern ein Zeithüter und damit in der Lage, in die Vergangenheit zu reisen. Das hat auch Nimrod, der Weltherrscher getan, und die Vergangenheit mittels sogenannter „Timelocks“ verändert, sodass er in der Zukunft, Jasons Gegenwart, die Weltherrschaft hat. Mit Namira begibt sich Jason auf die Mission, die Timelocks in der Vergangenheit zu finden und sie zu zerstören, um die Weltherrschaft Nimrods zu verhindern. Hierbei müssen sie sich Gefahren in der Vergangenheit stellen, wie kriegerischen Neandertalern in der Steinzeit oder manipulierten Mumien im alten Ägypten. Jedoch gelingt es ihnen, mit der Hilfe eines ägyptischen Sklavenjungen, den ersten „Timelock“ zu zerstören und sich auf die Suche nach dem nächsten zu machen.

Parallel zu diesen Ereignissen verändert sich für die japanischen Straßenkinder Otaku und Hana ihre gewohnte Welt, denn jede Veränderung in der Vergangenheit hat Auswirkungen auf deren Gegenwart. So verschwinden Menschen oder die von beiden heißgeliebten Bücher. Doch nur Hana bemerkt dies. Auf der Suche nach der Ursache hierfür entdecken die beiden das Geheimnis um Hanas Herkunft und kommen wie Jason in Kontakt mit dem Widerstand gegen Nimrod, die sich selbst „Zeitrebellen“ nennen.